Tout d'abord il ne faut pas oublier que Pannekoek était un scientifique internationalement reconnu, ce que lénine n'était évidemment pas (même si la propagande stalinienne a pu dire des choses de ce genre). Sur ces sujets le premier était infiniment plus au point que le second.
Parler de "philosophie léniniste" en soi est peut-être un peu abusif, vu que lénine tient en fait à peu près tout de plékhanov et de kautsky. En tout cas il est certain que lénine a défendu des idées opposées à Marx sur plusieurs points, notamment sur l'origine de la conscience communiste. Comme le souligne piter, lénine n'avait pas pu lire "L'Idéologie allemande", mais Rosa Luxemburg non plus et elle était pourtant arrivée à la même conclusion que Marx : la conscience communiste vient du prolétariat (en lutte).
Lénine, reprenant Kautsky, considérait que cette conscience "ne pouvait pas" (lénine souligne ces mots dans "Que faire ?") venir du prolétariat, mais d'une partie "éclairée" de la bourgeoisie. Il est évident qu'il y a là un clivage fondamental, entre d'un côté Marx/Luxemburg/etc..., et de l'autre Kautsky/Lénine/etc... Faire passer le point de vue des seconds comme de la "philosophie marxiste" est tout simplement faux.
Sinon, voir des léninistes / trotskystes se plaindre de "mauvaise foi" dans la polémique, c'est fort, tant lénine et trotsky en ont été spécialistes (trotsky atteignant des sommets dans les années 30 : tous ceux qui le critiquaient à un niveau ou un autre, notamment sur sa gauche, avaient selon lui "renoncé au marxisme")...